Именно у нас, на территории Республики Бурятия, был создан первый заповедник страны. В последующие годы количество природных объектов, относимых к ООПТ, неуклонно возрастало. К настоящему времени в республике сформирована сеть ООПТ федерального, регионального и местного значения. 

В 2004 г. все заказники получили единый статус «государственный природный биологический заказник регионального значения» (постановление Правительства РБ от 24 марта 2004 г. №55). Их территории включают различные природные зоны – таежные, степные и водно-болотные угодья, расположенные в равнинных и высокогорных участках. В ходе реформы органов государственной власти РФ и в связи с ликвидацией Бурятохотуправления в течение 2004–2005 гг. произошла передача заказников регионального значения в ведение Минприроды РБ. Функции дирекции заказников – охрану, воспроизводство, регулирование использования и учет численности объектов животного мира – на территории заказников регионального значения осуществляет с 2005 г. созданное Постановлением Правительства РБ от 15.07.2005 г. №231 Бюджетное учреждение «Природопользование и охрана окружающей среды Республики Бурятия» (БУ «Бурприрода»), входящее в структуру Минприроды РБ. 

Проведение биотехнических мероприятий в сочетании с охраной, борьбой с хищниками, снижением антропогенных факторов позволяет утверждать о наличии положительной корреляции численности животных в заказниках РБ. Особого внимания заслуживает вопрос совершенствования форм и методов управления заказниками. В республике имеется положительный опыт по применению метода ландшафтно-экологического планирования территории Прибайкальского заказника. Основной целью данного метода является установление различных зон на основе определения всех ключевых биотопов, важных для сохранения природных ценностей, и установление в соответствии с зонированием уровня лесопользования на данной территории. Особая роль заказникам отводится в сохранении и мониторинге «краснокнижных» видов животных. 

Природно-заповедный фонд Республике Бурятия представлен следующими ООПТ: 

1) федерального значения – 2 биосферных и 1 природный заповедник, 2 национальных парка, 3 государственных природных заказника федерального значения. 

2) регионального значения – 13 заказников, природный парк, рекреационная местность, 57 памятников природы. 

3) 5 рекреационных местностей местного значения. 

Заказникам Республики Бурятия более 30 лет. 

Началом существующей ныне системы республиканских заказников послужило создание в 1966 первого государственного охотничьего заказника «Алтачейский» в Мухоршибирском районе. Из заказников три находятся в непосредственном соприкосновении с озером Байкал: «Верхне-Ангарский», «Энхалукский» и «Прибайкальский». Госзаказники «Боргойский», «Верхне-Ангарский», «Тугнуйский» созданы во исполнение международных конвенций по охране перелетных птиц и среды их обитания, что определяет их уровень и статус. Остальные заказники ориентированы на сохранение численности и воспроизводство охотничье промысловых животных.