В 1972 году окончил Шарагольскую среднюю школу и поступил в культпросветучилище г. Улан-Удэ на отделение хореографии. Страстное желание танцевать появилось еще в школьные годы. Природная пластичность, яркая сценическая внешность, виртуозная техника, трудолюбие и любовь к своей профессии позволили ему после окончания училища в 1975 году войти в состав прославленного ансамбля песни и танца «Байкал» (ныне Бурятский государственный национальный театр песни и танца «Байкал») и обогатить его репертуар. хореографический факультет ВСГАКИ.

Зрители с восторгом и замиранием смотрели в его исполнении зажигательные танцы народов мира: индийские, казахские, калмыцкие, башкирские, бурятские, русские. В массовых танцах, вошедших в золотой фонд ансамбля «Байкал», таких как «На берегу Онона», «Наездники», «Семейский», «Наадан», «Русский лирический», он исполнял сольные партии. 

Его гастрольные маршруты пролегли по всей необъятной территории бывшего СССР, артист неоднократно выезжал с концертными программами в зону Чернобыльской АЭС. 

Выступления С.Э. Аюшеева отличались большой эмоциональностью, чувством стиля, артистизмом. Яркая индивидуальность, высокая культура и мастерство исполнения были признаны на международных фестивалях: в Монголии (1984,1990), Сингапуре, Малайзии (1994), Турции и Ираке (1995). Ему рукоплескали благодарные зрители Японии, Китая, Голландии, Бельгии.

С.Э. Аюшеев — дважды участник Дней культуры Бурятии в Москве (1983, 1996), Новосибирске (1987), Киеве (1993), принимал активное участие в концертах мастеров искусств, посвящённых 850-летию г. Москвы (1997). 

Сергей Эрдынеевич по праву считается одним из заслуженных солистов ансамбля песни и танца «Байкал». За годы работы в ансамбле у него раскрылся талант балетмейстера-постановщика. Его оригинальные постановки хореографических миниатюр, основанных на бурятском фольклоре, сюита «Сурхарбан», женский танец «Подснежники», сольный танец «Бег иноходца», бурятский ёхор и другие собирают аншлаги. 

Ветеран труда, сам в своё время заочно окончивший хореографический факультет ВСГАКИ, ныне щедро дарит свою любовь и знания студентам. На базе городского Дворца детского и юношеского творчества в 2008 году Сергей Аюшеев создал детский хореографический ансамбль «Сэргэ». Его воспитанники уже громко заявляют о себе, становясь лауреатами престижных конкурсов. В 2009 году на международном конкурсе хореографических коллективов ансамбль завоевал Гран-при. В 2010 году на межрегиональном конкурсе «На балу у Терпсихоры» занял второе место, а в 2011 в Москве его питомцы стали лауреатами первой премии. Две его ученицы из школы № 29 Дарима Цыбикова и Алина Мао стали лауреатами 1-й и 2-й премий. 

Преданный искусству, набравший опыт и мастерство в ансамбле «Байкал», артист работает над созданием репертуара, концертных программ ансамбля ветеранов, организованного им на общественных началах в 1997 году. С большим вдохновением ставит хореографические миниатюры, сочетающие в себе современную пластику и характерные бурятские национальные танцевальные элементы. 

Есть ещё одна грань таланта артиста — горловое пение. Сергей Аюшеев прошёл стажировку в Улан-Баторе по горловому пению «Хееми» у известного багши Отсурена. Возвышенно, с большим мастерством исполняет он старинные бурятские обрядовые песнопения — магтаалы. Свежо, выразительно, проникновенно звучат в его исполнении фольклорные бурятские песни: «Тори», «Алтай магтаал», «Дунжэн гарба», «Моя Бурятия» и многие другие. Горло¬вое пение — вторая профессия артиста. Показатель высокого профессионализма Сергея Аюшеева — многочисленные награды всероссийских, республиканских, международных конкурсов, фестивалей, дипломы лауреата престижных премий.

За за¬слуги и высокие достижения в области профессионального хореографического искусства С.Э. Аюшееву присвоены почётные звания заслуженного артиста РБ (1992), народного артиста Республики Бурятия (1996), заслуженного артиста Российской Федерации (2002). Его подвижническая, трудовая и творческая деятельность отмечена многочисленными престижными наградами, дипломами, грамотами международных, российских, республиканских уровней. В связи с 50-летием со дня рождения и 30-летием творческой деятель¬ности С.Э. Аюшеев был награжден Почётной грамотой Народного Хурала.

С сентября 2002 года Сергей Эрдынеевич Аюшеев работает в Бурятской государственной филармонии художественным руководителем ансамбля «Селенга».

Супруга Цыпилма Аюшеева — солистка театра песни и танца «Байкал», лауреат и дипломант многих международных конкурсов, народная артистка Республики Бурятия.

Их сын Саян, 1984 г.р., продолжил творческую династию родителей. В 2001 г. в составе Бурятской филармонии побывал на гастролях в Словении и Германии. В 2002 году окончил Бурятское республиканское хореографическое училище. Будучи студен¬том, выезжал на гастроли в Тайвань в составе студенческого ансамбля. После окончания училища два года работал в Бурятском государственном академическом театре оперы и балета артистом балета. В 2004 г. Саян прошел кастинг и поступил в труппу Имперского русского балета в Москве. В составе этой труппы он объехал ОАЭ, Кипр, Грецию, Новую Зеландию, Финляндию. Саян — лауреат межрегионального кон¬курса артистов балета (г. Санкт-Петербург). В настоящее время он — артист балета Бурятского государственного академического театра оперы и балета им. н.а. СССР Г.Ц. Цыдынжапова. 

Младший сын Эрдэни, 1989 г.р., окончил школу № 65 в 2007 году. Спортсмен, играл в футбол в сборной команде «Локомотив». В настоящее время студент медицинского университета г. Хух-Хото в КНР.

Автор:Надежда Гончикова